Les associations départementales élisent des représentants qui siégeront au conseil d’administration (CA) de l’AEGSEG. Ce dernier, composé du conseil exécutif (CE) et d’un représentant de chaque association départementale, est responsable de la gestion générale de l’association. Le CA vote des résolutions et voit au suivi des décisions prises en assemblée générale.
Le CE assure quant à lui la gestion courante de l’association et met à exécution les résolutions votées en assemblée générale et en conseil d’administration.
L’assemblée générale permet à l’ensemble des membres de se prononcer et de voter sur les orientations de l’AEGSEG. Elle procède à l’élection du conseil exécutif et adopte les budgets et états financiers de l’association.